孩子在患有鵝口瘡的情況下注射疫苗，可能會產生不良後果，具體表現在以下幾方面：

1、加劇不良反應：可能會使孩子注射疫苗以後的不良反應明顯加劇，因為鵝口瘡屬於念珠菌感染，即屬於真菌感染。孩子在真菌感染的狀態下，體內免疫狀態處於激活狀態，但是注射疫苗也是為了激發免疫反應，可能會使、注射疫苗的不良反應加劇，從而表現為發燒、煩躁不安等不良反應；

2、免疫反應異常：在患有鵝口瘡時，體內的免疫反應處於病理狀態，此時注射疫苗，抗原進入機體後不能有效產生特異性抗體，使疫苗的注射效果大打折扣。