肛門檢查是常用的檢查方法，也是重要的檢查方法，檢查項目根據檢查方式不同而不同，常見檢查如下：

1、視診：觀察肛門周圍有無痔團、溼疹、瘻口等。肛瘻患者通常在5cm以內的肛門周圍區域，可以看到瘻口，外痔患者可以看到外痔痔團，肛門瘙癢患者可以觀察到是否有溼疹，有無皮膚增厚等；

2、觸診：包括指診，檢查肛門括約肌張力是否正常，部分患者可能伴有肛門狹窄，這時會出現排便困難。部分患者可能有肛門失禁，肛門失禁患者可能伴有肛門鬆弛、肛門括約肌不完整，需要檢查肛門直腸情況。大概50%的直腸癌會發生在直腸下段，在做指診時可摸到直腸下段腫瘤。如果在直腸內摸到腫塊，可以懷疑是否有異常，這時要確定腫塊大小、位置、活動度、質地等，做進一步腸鏡檢查，取活檢確定性質。通常還可以摸到男性前列腺，女性子宮頸，屬於人體正常生理結構；

3、肛門鏡檢查：在直腸指診後有時會給患者做肛門鏡檢查，進一步明確是否有腫物。