肺結核確診標準為痰檢陽性，如痰找抗酸染色陽性或痰培養檢出結核桿菌、痰分子生物學檢測陽性、影像學支持肺結核。痰菌陰性、三次痰塗片及一次痰培養陰性，診斷標準如下：

1、典型臨床症狀和胸部影像學表現，例如有結核中毒症狀患者會出現納差、乏力、消瘦、午後低熱、夜間盜汗等，女性患者會有月經紊亂等。存在呼吸道症狀例如咳嗽、咳痰、咳血，部分患者伴有胸痛。影像學表現例如胸片和肺部CT提示一側或雙側肺部有結核樣病灶；

2、抗結核治療有效；

3、臨床可排除其它非結核性肺部疾患；

4、PPD強陽性，血清結核抗體陽性；

5、痰結核菌PCR及探針檢測陽性；

6、肺外組織病理證實結核病變；

7、支氣管肺泡灌洗液檢出抗酸分枝桿菌；

8、支氣管或肺組織病理證實結核。

如果患者符合上述1-6項的中三項，或7-8中任何一項，即可確診為肺結核。