核磁共振檢查對於腰椎間盤突出的診斷比較準確，在骨科臨床上，核磁共振檢查是診斷腰椎間盤突出，常用且準確的檢查手段。核磁共振檢查，對於腰椎間盤突出的診斷，可以從定性到定量均較為準確，可以看到腰椎間盤突出的部位是哪一節或有幾節。另外對於神經壓迫的程度、相關的骨關節病變，以及神經本身是否有病變等，均可準確檢查出。

骨科醫生，特別是脊柱外科醫生，通過核磁共振對腰椎間盤突出的檢查，對疾病進行準確判斷，還可以對手術設計更加精確。但因為核磁共振檢查屬於一種強磁檢查，所以患者體內如果有金屬，特別是不鏽鋼的內植物，便不能進行核磁共振檢查。因此在核磁共振檢查之前，要確定患者體內沒有鋼製內置物。