感染性心內膜炎是臨床比較棘手的一種疾病，它的治療週期治療時間非常長，它的臨床表現往往在早期也不典型，往往有一些栓塞或者其他的臨床表現，或者長期不明原因的低熱作為首發臨床表現，才不斷的通過臨床檢查手段，做心臟超聲或者做細菌培養，或者做其他相關檢查去臨床明確。抗感染比較麻煩，需要針對不同的致病菌選擇一個合理的抗生素，而且必須給予長達八週甚至時間更長的一個抗感染藥物治療，才能進行徹底治療。有的患者得了感染性心內膜炎以後，通過很長時間的抗炎治療，也不能得到很有效的控制，只能做心臟手術來進行切除感染灶的治療，臨床非常棘手，至於選擇什麼抗生素，在不同的患者身上也沒法明確，一般相對來說是使用能夠透壁性、殺菌力更好的抗生素非常有效。