幽門螺旋桿菌準確稱為幽門螺桿菌，可以用試紙測出來，除了用試紙測，還可以在顯微鏡下，通過特殊的染色觀察到幽門螺桿菌的存在。也可以將活檢的組織進行聚合酶鏈反應，觀察是否存在幽門螺桿菌核糖核酸的片段。

常見的試紙檢測的方法為快速尿素酶試驗，是利用尿素酶試驗的方法來檢測。快速尿素酶試驗是把胃內取出的活檢組織，與含尿素酶和酚酞的試紙片混合。由於幽門螺桿菌可以分泌尿素酶分解尿素產生氨氣，氨氣遇水成為鹼性，酚酞在鹼性的條件下變紅，所以如果活檢組織中存在幽門螺桿菌，就會使試紙變紅，這樣可以粗略判斷是否存在幽門螺桿菌感染。

若幽門螺桿菌感染的患者，正在服用有根除幽門螺桿菌的藥物，經過檢測可能會出現假陰性的情況，建議可以結合碳呼氣試驗、糞便檢測、抽血檢測、病理學檢測等檢查方式綜合進行判斷。