三叉神經痛一般選穴方法分為局部取穴、循經取穴，局部取穴主要在疼痛點或三叉神經走行位置針刺。三叉神經存在扳機點，觸摸可能誘發三叉神經痛，此時可針刺局部扳機點進行治療，如較常應用下關穴等。上支存在問題可針刺攢竹穴、太陽穴、魚腰穴、地倉穴、迎香穴等；下支存在問題可針刺承漿穴、夾承漿穴等。

遠端取穴即循經取穴，由於三叉神經痛一般為肝膽火旺所致，因此需要疏瀉肝膽火以及胃火。瀉肝膽火一般可應用陽陵泉、太沖、行間等肝經、膽經穴位，瀉胃火可用足三里、上巨虛、合谷等穴位。