大部分三叉神經痛都可以根治，但臨床存在個別頑固性三叉神經痛治療較為困難，會影響治療效果。三叉神經痛治療需要關注頭顱病變，通常由於腫瘤或膽脂瘤以及其它顱內佔位性病變導致繼發性三叉神經痛。由於治療較為困難，因此根治性存在一定差別。

原發性三叉神經痛由於病因不明確，因此通常都採用半月神經節射頻、伽瑪刀治療以及卵圓孔氣囊壓迫治療。這三種治療方法由於術後都會存在一定副作用，因此患者需要根據自身情況選擇。伽瑪刀治療副作用相對較少，患者痛苦較小，但是複發率較高。

微血管減壓術受患者年齡、體質限制，因此通常限制老年人選擇微血管減壓。半月神經節射頻手術會產生不同程度面部麻木，但風險較小、創傷較小，治療相對徹底。