三叉神經疼痛劇烈的患者，若經口服藥物治療無效可考慮手術治療。未經藥物治療者可試服卡馬西平或奧卡西平，若口服藥物可控制三叉神經痛發作，可口服藥物治療。若口服藥物治療後仍發作，且疼痛劇烈，建議手術治療。

由於三叉神經痛根據發病機理，只有手術治療，才可解決三叉神經痛被相鄰血管侵犯的可能性。而手術方式是在三叉神經和血管之間墊一個脂肪墊，使神經不再受到相鄰血管的侵擾，就不會產生疼痛，同時對三叉神經做處理，做完手術後疼痛會大部分消失。