三叉神經痛初期症狀主要為發作性面頰部和眼瞼部疼痛，面頰部和眼瞼處是三叉神經支配區域。三叉神經主要管理感覺，故三叉神經痛可引起相應部位出現疼痛。疼痛存在發作性、短暫性特點，發作後多可恢復正常，發作時常呈電灼樣、刀割樣疼痛。疼痛發作時間為數秒至數分鐘，初期發病時間短，隨著病程延長，發病時間可逐漸延長，而且發作頻率可逐漸頻繁。

除此之外，此類疼痛具有扳機點，即具有啟動因素，患者在刷牙、洗臉或者進食時可誘發疼痛，患者通常會避免此類動作，臨床中部分患者因恐懼誘發劇烈疼痛而絕食或厭食可導致消瘦。目前提倡採用微創手術治療三叉神經痛，神經內鏡下可以全程看到神經和微血管全層壓痛點、扳機點和責任血管，視野更清晰，有利於手術痊癒，患者痛苦減少。