各種原因引起的腎臟結構和功能障礙，使得腎臟不能將體內代謝產生的廢物和過多的水分排出體外，從而引起水腫、高血壓、貧血、代謝性酸中毒、高血鉀以及多臟器功能受損的終末期成為尿毒症，以下幾種情況都可能成為尿毒症的發病原因。

1、各種原發性的腎小球腎炎，例如lgA腎炎、膜增殖性腎炎、急進性腎炎、膜性腎炎等。

2、繼發於全身性疾病，例如系統性紅斑狼瘡、過敏性紫癜、糖尿病、高尿酸血癥、長期高血壓等引起的腎功能損害。

3、慢性炎症感染導致的腎功能下降，如慢性腎盂腎炎、腎結核等。

4、泌尿系統的結石、狹窄和梗阻等：如腎結石、雙側輸尿管結石、尿道狹窄、前列腺增生、尿道腫瘤、盆腔腫瘤累及輸尿管等。

目前引起尿毒症的第一大病因因是慢性腎炎，第二大病因是糖尿病腎病，第三大病因是高血壓腎損害。但是隨著糖尿病發病率的增加，已經逐漸要取代慢性腎炎成為引起尿毒症的第一大病因。