對於主動脈支架的後遺症，可以理解為是併發症，主要是將來支架會再狹窄。針對支架再狹窄的情況，主動脈支架植入以後觀察位置，如果胸腹部位植入支架覆蓋了頸動脈，沒有做開窗可能會引起大腦缺血，但這類併發症很少。因為支架在腹膜的位置，可能要覆蓋部分重要血管，相對會引起部分症狀，現在已經很少，以前可能會引起病人下肢功能受損，比如覆蓋掉脊髓前動脈可能會引起上述症狀。

另外，腎動脈或者腸繫膜動脈堵塞，引起相關部分症狀，但只有特別複雜的情況，必須覆蓋部分功能性血管才可能發生，現在基本上有開窗手術，後遺症或併發症會越來越少。