肌肉萎縮指橫紋肌營養障礙，肌肉纖維變細甚至消失等導致的肌肉體積縮小。治療上主要分為以下三個方面：

1、規範康復運動治療：對於肌肉萎縮引發的肢體運動障礙，患者經過正規的運動治療，可明顯減少或減輕癱瘓後遺症。不應忽視對患者的關節活動度、肌張力及拮抗之間協調性的康復治療，以免患者肌力恢復正常但也有異常運動模式；

2、強調肌肉協調性訓練：不適當的肌力訓練可以加重痙攣，適當的康復訓練可以使痙攣得到緩解，從而使肢體運動趨於協調。一旦使用了錯誤的訓練方法，如患者的手反覆練習用力抓握，則會強化患者上肢的屈肌協同，使得負責關節屈曲的肌肉痙攣加重，造成屈肘，屈腕旋前，屈指畸形，使得手功能恢復更加困難。其實肌肉萎縮，肢體運動障礙不僅僅是肌肉無力的問題，肌肉收縮的不協調也是導致運動功能障礙的重要原因，因此不能誤以為康復訓練就是力量訓練；

3、其他治療：包括低頻或中頻電刺激、神經營養藥，同時可以配合針灸、電針、推拿、中藥等治療。