腦囊蟲病手術的治療效果與腦囊蟲病的範圍、部位有關：若患者顱內有多發的囊蟲，不能通過一次手術切除每個部位，只是解決主要問題，其他部位有殘留的可能，則病人會有好轉但不能得到治癒；若患者腦囊蟲侷限於某個部位， 可以通過一次手術將囊蟲摘除，同時解決囊蟲腦囊蟲病引起的腦積水，則病人可以得到治癒。