閉塞性細支氣管炎治療包括抗炎治療、對症治療以及其它治療。需要定期隨訪，根據病情變化以及治療效果調整治療方案。抗炎治療包括使用糖皮質激素、大環內酯類抗生素以及孟魯司特等，對症治療包括氧療、呼吸支持、肺部理療、營養支持等。持續低氧的患者需要氧療，嚴重時可能需要呼吸機支持治療。肺部理療可以幫助兒改善呼吸道分泌物瀦留情況、幫助肺不張患者復張。

閉塞性細支氣管炎出現反覆呼吸道感染，如發熱、喘息加重、痰液增多等，建議使用抗生素。其它治療還包括中藥治療以及肺移植等，閉塞性細支氣管炎預後較好，通常病情不會再進展。