毛細支氣管炎以咳喘症狀為主，重症病例可以有乏氧的表現，需要給予氧氣補充，進行吸氧治療。並且根據病情的輕重、孩子的年齡，選擇面罩吸氧或鼻導管吸氧，針對喘息發作，需要給予霧化吸入速效支氣管擴張劑聯合吸入糖皮質激素進行治療。如果經過霧化治療，仍然存在明顯的喘息表現以及呼吸困難、乏氧症狀，需要加用口服或靜脈給予糖皮質激素治療。

絕大多數的毛細支氣管炎是由病毒感染引起，在治療方面不需要應用抗生素，可以選擇抗病毒的藥物，但目前尚未有特殊、有效的抗病毒藥物，可以試用干擾素霧化吸入，有一定的效果。對於合併細菌感染、支原體感染的患兒，需要選擇相應敏感的抗生素。如果喘息症狀加重，會通過呼吸道丟失較多水分，可以給予靜脈補液治療，防止出現脫水症狀。而如果患兒有胃腸道症狀，也需要進行相應的對症治療。