阿莫西林屬於抗細菌、微生物藥物中的青黴素類藥物，主要是針對細菌，尤其是革蘭氏陽性菌治療效果最好，如流感嗜血桿菌或肺炎鏈球菌。阿莫西林對厭氧菌也有作用，口腔感染如牙周炎，厭氧菌和革蘭氏陽性菌，使用阿莫西林治療效果比較好。但是對革蘭氏陰性菌治療效果相對比較弱，所以有時會建議換用其它類藥物進行治療。

阿莫西林屬於青黴素類藥物，所以不管是口服還是靜脈使用這類藥物，要求必須做青黴素皮試，一週內用過或最近三天之內做過青黴素皮試陰性，才能使用阿莫西林。有時換一個批號會新出現過敏反應，可致死，需引起注意。