男性生殖道支原體感染，其治療主要是要選擇消炎藥，至於選擇何種消炎藥，最好是要根據支原體培養及藥敏試驗的結果來選擇。如果尚未做藥敏試驗，則只能根據經驗性用藥，最常用的抗生素主要有以下幾類：

1、大環內酯類抗生素，如克拉黴素、羅紅黴素、阿奇黴素。

2、喹諾酮類抗生素，如左氧氟沙星、氟羅沙星、莫西沙星等。

3、四環素類抗生素，如美滿黴素。

對於伴有尿道灼熱或尿頻、尿急等症狀時，可以加用具有利尿通淋的中成藥治療，比如熱淋清顆粒、萆解分清丸等。