兒童支原體感染，目前最多見的就是呼吸系統的疾病，比如支原體肺炎。一般治療使用藥物需要連續兩週以上，選擇大環內酯類藥物治療為主，比如選擇紅黴素治療兩週以上之後可以複查。

阿奇黴素首先一般連續使用3天、停3天，再繼續使用3天，按照這樣的規律療程達到兩週的時間。兩週以後，複查血常規和胸片或肺部CT，檢測血漿中的肺炎支原體IgM的滴度水平，對於判斷病毒的恢復程度沒有太大的意義。