支原體是一類沒有細胞壁的病原微生物，所以它的感染不能夠使用頭孢菌素類的抗生素或者青黴素類的抗生素，因為其主要作用機制是破壞細胞壁，支原體沒有細胞壁，所以這一類抗生素是無效的。需要選擇其他作用機制的抗生素，主要是選擇大環內酯類、氟喹諾酮類以及四環素類抗生素。具體大環內酯類抗生素可以選擇紅黴素，也可以選擇阿奇黴素，其它的交沙黴素、克拉黴素也可以進行選擇。

根據病情的輕重，可以選擇口服或者是靜脈應用，這一類抗生素成人或者孩子都是可以使用的。如果選用氟喹諾酮類的抗生素，可以選擇左氧氟沙星或者環丙沙星等，需要注意在18歲以下不能夠使用。對於四環素類的抗生素，可以選擇四環素或者多西環素，也需要注意，在8歲以下不能使用。