肺囊腫較小，直徑＜2cm者，注意定期觀察即可；若肺囊腫較大，預示囊腫還可繼續增長，建議手術切除。目前治療方法多采用胸腔鏡手術切除，常用單孔胸腔鏡，囊腫直徑＞2cm者，均建議手術切除，一般預後較好。部分患者發現囊腫時，體積較大，甚至已出現相應臨床症狀，則必須及時進行正規治療；患者早期感染較輕，可採取擇期手術；若感染較嚴重，則需採取呼吸、引流等治療，待情況改善後，才可進行手術切除。