支氣管結核的治療時間比肺結核更長，最短的治療時間在一年以上，甚至有的患者恢復較慢，治療要超過一年。判斷治療療效主要是複查支氣管鏡，瞭解支氣管恢復情況，同時複查肺部CT，觀察肺部病灶恢復情況然後再決定其治療療程。

支氣管結核治療療程取決於病情恢復的情況，而支氣管結核的治療時間在一年左右，大部分人都可以恢復正常。服用藥物的強化期時間長，鞏固期同樣較長。