經支氣管鏡腔內冷凍治療，是相對安全的手術，基本上沒有後遺症。但是在操作的過程中，特別是凍切的過程中，因為冷凍的黏附作用，撕傷力比較大，需防止大出血的發生。

經支氣管鏡冷凍主要是治療肺結核，特別是支氣管結核引起的肉芽腫的切除，療效比較確切。還有腫瘤病人晚期得姑息治療，可緩解病人呼吸困難的症狀，效果顯著。

所以，經支氣管鏡腔內冷凍治療是相對安全的操作。在術前進行充分的心肺功能和其他臟器的評估，併發症很少見。