肺大皰是肺臟的結構的改變，處理也是根據成因以及根據大小，位置以及併發症的情況來決定。先天性肺大皰，有些患者肺臟的結構局部發育有問題，這個時候也可以形成肺大皰。不是所有的肺大皰都是非常大的大泡，有些是很小的，這時如果沒有改變呼吸功能，沒有頻繁的破裂導致氣胸發生，其實不需要特殊的進行處理。
還有病人是由於慢性的氣道疾病導致肺臟結構和功能的破壞，這個時候一旦出現了多發的肺大皰，就往往預示著肺臟功能的異常或者功能異常加重，這個時候就要進行基礎疾病的治療。如果肺大皰是孤立的，比較侷限，嚴重影響患者的肺功能，這個時候也是可以進行手術處理，否則常規的根據基礎疾病進行處理就可以。有的患者肺大皰的位置和結構特別容易破裂，反覆出現氣胸的情況，也可以考慮手術進行治療，或者進行胸膜的粘連或固定處理，防止頻繁的出現氣胸。