肺部曲黴菌感染的表現有幾種類型，侵襲性肺麴黴菌病、孤立的麴黴菌球、侵犯到氣管支氣管、變態反應。

所以不同的疾病類型可能治療手段不同，嚴重侵襲性肺麴黴菌病，要積極抗感染治療，應用抗菌黴菌藥物，括用伊曲康唑、伏立康唑等。

還要維護病人呼吸功能，因為嚴重侵襲性肺麴黴菌病，病人的呼吸功能有影響，可能有缺氧情況，要進行呼吸支持。如果是麴黴菌球，且沒有嚴重症狀，患者可能不需要立刻積極治療。

但是有些病人可能會有症狀，尤其可能會出現咯血，甚至致命性大咯血，可能會導致窒息，這種人要積極處理。

治療方法也包括抗菌黴菌藥物，甚至可能要止血治療，也可能通過手術切除麴黴菌感染導致的空洞，才能夠達到治療的目的。

還有類似於哮喘樣發作、變態反應性麴黴菌感染，要抗麴黴菌治療，另要使用治療哮喘的藥物進行綜合治療。所以不同的情況治療方法不同，但多數情況下要使用抗麴黴菌藥物。