對於過敏性咳嗽的治療首先要脫離過敏原，如部分病人對油漆過敏，此時需要脫離過敏原油漆；部分患者對粉塵、塵蟎過敏，可能會通過藥物進行治療，如應用糖皮質激素進行抗炎治療。另外，支氣管擴張劑，如β受體激動劑、口服茶鹼均可暫時緩解咳嗽症狀，但不建議單獨長期使用，並且可以應用抗過敏藥，如使用氯雷他定等藥物。

對於停藥後反覆發作的病人，需要明確過敏原，也可進行脫敏治療。還可以進行白三烯調節劑治療，如長期口服孟魯司特鈉。過敏性咳嗽的治療一般持續時間比較長，以免症狀反覆出現，甚至影響到患者的肺功能。如果不進行長期正規治療，後期則可能會影響病人的肺功能。