腦心通是由黃芪、丹參、當歸、川芎、赤芍、紅花等十六味藥材所製成，具有益氣活血、化瘀通絡的功效，臨床多用於治療氣虛血滯、脈絡瘀阻所致中風，包括半身不遂、口眼歪斜、胸痺心痛、心悸氣短等症狀，也可用於腦梗死、冠心病、心絞痛等屬上述症候者。目前藥物副作用尚不明確，但使用不當時，可能產生不良反應。
1、胃腸道反應：腦心通包括地龍、全蠍、水蛭等動物類中藥，存在一定藥物毒性，可能對胃腸道造成刺激，少數患者服用後會有輕度胃腸道反應，如胃痛、噁心、食慾減退等，尤其既往存在消化道潰瘍等胃腸道疾病的患者，不適症狀可能會更加嚴重。
2、氣虛：腦心通中除含有黃芪、當歸等補氣血的藥物外，還包括川芎、桃仁、紅花、赤芍等具有活血、化瘀、通絡作用的藥物。若患者藥物使用不當，可導致耗氣破血，損傷人體正氣，甚至導致氣虛，出現乏力、大汗等症狀。
3、其他：極個別患者服用後可能出現皮膚瘙癢、脫皮、丘疹、倦睡、心煩、頭悶等症狀。
患者用藥後出現不適症狀需要及時就醫明確原因，如果是服藥所致，通常停藥後即可消失，服藥期間避免陽光直射，高溫及過久站立，有心律失常、嚴重心臟病、肝腎功能不全的患者需謹慎用藥。