甲亢臨床又稱甲狀腺功能亢進症，碘-131治療甲狀腺功能亢進症相對較好。碘-131治療甲狀腺功能亢進症已經有60多年的歷史，隨著碘-131應用的增多，手術治療者較以前相對減少。碘-131治療甲狀腺功能亢進症的特點是安全、簡便、費用低、效益高，總有效率達95%以上，臨床治癒率達85%以上，複發率＜1%。研究顯示，碘-131治療沒有增加甲狀腺癌和白血病等癌症的發生率，且不會影響患者的生育能力和增加遺傳缺陷。

碘-131在患者體內主要蓄積在甲狀腺內，對甲狀腺以外的臟器，如心臟、肝臟、血液系統等不造成急性輻射損傷，因此可以比較安全地用於患有上述臟器合併症的重度甲狀腺功能亢進症患者。需要注意的是該治療主要的併發症是甲狀腺功能減退，而發生甲狀腺功能減退後，患者則需長期使用甲狀腺素替代治療。

手術治療甲狀腺功能亢進症的治癒率是95%左右，複發率為0.6%-9.8%，其中手術的併發症包括永久性甲狀腺功能減退，其發生率在4%-30%，而發生甲狀腺功能減退後，患者同樣需要長期使用甲狀腺素替代治療。而且手術治療還可能引起甲狀旁腺功能減退，以及喉返神經損傷。