雖然酒精與甲狀腺本身沒有相關性，但仍不建議甲狀腺功能減退患者飲酒。甲狀腺激素的合成和釋放主要與碘源性物質相關，所以單從甲狀腺激素合成、釋放這個角度，酒精不限於或不禁用於甲狀腺功能異常的患者。甲狀腺激素調節全身各個臟器組織、功能，或糖、脂、蛋白質等物質的代謝，甲狀腺激素水平下降，會出現臟器內的代謝功能下降。患者飲入酒精，需要從肝臟進行代謝，當出現嚴重甲狀腺功能減退時，肝臟對酒精的代謝能力下降，患者容易出現酒精中毒。

甲狀腺激素是種應激性激素，人體飲用大量酒精後可能出現酒精中毒，表現為噁心、嘔吐、頭疼、頭暈等，此時正常人分泌的甲狀腺激素會增多，應對應激狀況，而甲狀腺功能減退的患者，由於甲狀腺激素合成水平的下降，對抗應激的能力會下降，所以不建議甲狀腺功能減退的患者飲酒。