甲狀腺腫大是否能自愈，與導致甲狀腺腫的具體原因有明顯關係，如因缺乏碘而導致甲狀腺代償性增大，由於碘缺乏甲狀腺素合成受到障礙，如果長期碘攝入不足，會引起甲狀腺腫大，如果及時補充碘劑，甲狀腺腫大情況會自然消失。

特殊疾病導致甲狀腺腫大，大多需要進行藥物或手術治療，如甲狀腺腫瘤性疾病。由於甲狀腺腫瘤呈現為膨脹性生長，如果產生壓迫症狀，比如壓迫氣管、食管等，會引起相應呼吸和吞嚥困難。即使給予藥物或其他輔助治療，也不會對局部腫物產生過多影響，只有通過手術切除，才能去除導致甲狀腺腫大，同時會緩解相應症狀。進行甲狀腺腫大治療時，還要注意甲狀腺功能檢查，如果出現甲狀腺功能異常，要注意通過飲食與藥物輔助，平衡甲狀腺功能。