垂體柄阻斷綜合徵治療主要是激素的替代治療，具體如下：

1、如果出現促腎上腺皮質激素減少，通常用腎上腺皮質激素進行替代治療，臨床上常見的有糖皮質激素，如強的松等；

2、如果發現促甲狀腺激素分泌減少，可直接使用甲狀腺激素，最常見的左旋甲狀腺素片，即優甲樂，可補充甲狀腺激素；

3、促性腺激素減少，可以補充性腺激素，如女性的雌激素、孕激素，男性可補充睪酮類的激素。    

另外，要注意在進行激素替代治療時，注意控制補充的量，不能補過量，過量可出現副作用，而不利於人的身體健康。