兒童性發育異常可掛內分泌科或生長發育門診，此外還可就診於甲狀腺門診、腎上腺門診、鈣磷代謝門診、低血糖門診、PCO門診、遺傳代謝罕見病門診以及糖尿病管理門診等亞專科。

現在部分醫院還有性發育異常MDT，即多學科會診，包括內分泌科、泌尿外科、少兒女科、遺傳科、心理科、腫瘤外科以及B超室等，經過多學科會診後綜合制定最佳的治療方案。