甲狀舌骨囊腫作為普外科常規頸部手術，術後併發症主要如下：

1、近期併發症：如出血、感染，由於頸部血管、神經比較豐富，術後1-2日內都有出血的風險。常規手術術後出血在傷口中可以觀察到，但頸部手術縫合後，由於出血在皮下，外側為皮膚，內側為氣管。如果出血在皮膚與氣管之間，且出血較多形成血腫，可能壓迫氣管。另外，頸部甲狀舌骨囊腫中具有細菌，切除囊腫、瘻管時，細菌從囊腫流出。汙染視野或者術野，造成傷口感染。傷口近期1周左右發生的感染，通常會影響切口癒合，增加復發風險。所以出血是術後1-2天需要觀察的併發症，而炎症是需要術後5-7天密切觀察的併發症；

2、遠期併發症：如復發、瘢痕問題，如果出血、炎症控制較好，則複發率較低。另外，部分家長對美容要求比較高，如果頸部局部瘢痕比較重，可以用美容產品、消疤藥膏處理。