血液透析時要把血液從體內引出體外，經過透析裝置到透析機、到透析器再回到人體內，這時血液在體外循環，容易出現凝血酶原生成，以及纖維蛋白沉積，容易引起血液凝固。所以要在透析前的透析器內加入抗凝物進行預衝，透析過程中加入肝素治療。

過去普通的肝素需要用肝素泵給藥，現在隨著發展使用低分子肝素可以減少凝血狀態。而在病人心臟功能較好的情況下，增加血液透析流速也可以減緩凝血狀態，所以血液透析時要注意抗凝，順利進行透析。