腎臟萎縮常提示慢性腎損害，是疾病比較嚴重表示。慢性腎臟病如果是血壓控制不好或蛋白尿較多造成，如慢性腎功能不全、腎衰竭或尿毒症發展時容易出現腎臟萎縮。主要是因為慢性腎臟病導致腎小球硬化、小管萎縮、間質纖維化，從而導致腎臟萎縮、腎臟縮小，B超下腎皮質變薄、腎實質回聲增強、皮髓分界不清。一旦出現腎臟萎縮，均提示腎臟疾病慢性改變。

除原發病治療，如控制血壓、血糖、血脂、減少蛋白尿之外，還需要做到定期監測血壓及腎功能。適當控制蛋白質食物的攝入，減輕腎臟負擔，同時注意腎衰竭併發症的發生及糾正，如糾正腎性貧血、代謝性腎中毒、鈣磷代謝、繼發性甲狀旁腺功能亢進症。