血尿的來源分為內科來源和外科來源，可以先做尿紅細胞位相檢查，查看紅細胞的形態，如果紅細胞是以均一紅細胞為主，考慮血尿來源於外科原因，如感染、結石和腫瘤等。由於血液直接進入尿液中，所以紅細胞不會出現變形，如結石摩擦泌尿系統的黏膜或感染炎症直接刺激尿道感染，導致發生血尿。而如果紅細胞是以變形紅細胞為主，考慮是內科來源的血尿，紅細胞通過腎小球濾過膜的擠壓變形，導致形狀各異。此類情況可以見於腎臟問題，如腎小球腎炎、腎病綜合徵、慢性腎病，血液系統疾病或免疫系統疾病等，都有可能會導致血尿。

而在初步判斷來源後，需要進行深入檢查，首先結合患者具體症狀，如外科血尿，通常會伴隨尿頻、尿痛、尿道有分泌物等症狀，提示患者可能存在感染，劇烈的腰痛、下腹痛，可能是結石。其次根據患者的症狀，再選擇合適的檢查，如B超、CT或膀胱鏡等。對於內科血尿可能需要通過抽血，或尿液的化驗等明確病因。而目前對於血尿，主要是針對原發疾病進行治療。