目前對於硬皮病診斷主要依賴臨床表現和皮膚病理檢查，自身抗體16項檢查只有輔助診斷和指導預後作用。如果自身抗體16項檢查結果為陰性，同樣不能排除本病。一方面可能是假陰性，另一方面大部分侷限性硬皮病患者以及少數系統性硬皮病患者血清中自身抗體16項檢查結果可以為陰性。

自身抗體檢查在結締組織病中具有重要診斷價值，硬皮病中可出現陽性抗體，包括抗Scl-70抗體、抗著絲點抗體、抗核仁纖維蛋白抗體等，其中以抗Scl-70抗體最為常見，在系統性硬皮病中陽性率高達40%-70%，具有較高診斷價值，但不能單憑此項檢查診斷或排除硬皮病。