大部分反應性關節炎無需終生吃藥。反應性關節炎起病時大多是因為泌尿系或者腸道慢性感染逐漸引起，腸道多為革蘭氏陰性桿菌，而泌尿道是支原體、衣原體。如果早期發現，應用足夠療程的足量抗生素，可以殺滅病原微生物。

後期有免疫因素的參與，可能會引起關節疼、尿道炎、結膜炎等疾病，應用激素、免疫抑制劑即可壓制過亢的病理免疫。而對於生理免疫，可以採用中草藥調動機體本身固有的機能、改善體質，提高生理免疫力。經過數週或者數月系統、規範的治療，疾病可以達到臨床完全緩解，因此反應性關節炎無需終身用藥。