系統性紅斑狼瘡是一種高度異質性自身免疫性疾病，臨床表現多樣。早期症狀往往不典型，包括髮熱、疲倦、乏力、體重下降、脫髮、口腔黏膜潰瘍、關節肌肉疼痛等。此外還會出現光過敏，雙手雷諾現象。典型的患者會出現面部的蝶形紅斑以及甲周紅斑等。另外，系統性紅斑狼瘡患者還可以在腎臟、血液系統、肺、心血管、神經系統、消化系統等多系統出現損害及相應的系統表現。當系統性紅斑狼瘡患者併發有其它風溼性疾病時，可出現相應的臨床表現。比如系統性紅斑狼瘡合併有抗磷脂綜合徵，表現為動靜脈血栓、習慣性流產、血小板減少三聯徵。約30%的系統性紅斑狼瘡患者有繼發性乾燥綜合徵，表現為口乾、眼乾的症狀。