左氧氟沙星可以用於治療支原體感染，但在用藥前應確定支原體培養時進行藥敏試驗的結果。因為在常規支原體培養時會進行藥敏試驗，從而確定支原體敏感的抗生素類型，再從這種敏感的藥物中選擇藥物治療支原體。而左氧氟沙星對於支原體通常較為敏感，所以可以用於治療支原體感染。

對於反覆發作或已經使用抗生素治療支原體的情況下需引起注意，若支原體復發或長期治療無法轉陰，可能會使支原體產生耐藥。所以對於初次發現的支原體感染，使用左氧氟沙星較為有效。但如果感染反覆發作或長時間治療無法轉陰，則使用左氧氟沙星進行治療的效果較差。而其他抗生素，如阿奇黴素、紅黴素以及雷帕黴素等，用於治療支原體的效果也較為理想。