外界微生物對人體致病幾大病原體裡，其中就有衣原體和支原體，比較熟悉的最常見的是細菌、病毒。此外還有支原體、衣原體，以及真菌、螺旋體、立克次體等病原體。衣原體和支原體也是微生物，引起人體感染和細菌、病毒一樣，即支原體感染和衣原體感染。

引起不同部位的具體病變不一樣，比如支原體肺炎、衣原體結膜炎，支原體陰道炎等。衣原體有幾種，如衣原體的鸚鵡熱等等，只是病原體引起人類感染的一種疾病而已。衣原體感染和支原體感染都是一種疾病，與其它沒有直接關係。