腦部的脂肪瘤通常稱為顱內脂肪瘤，大部分腦脂肪瘤不是發生在腦室內，而是發生在顱內，一般不會有太大的風險。

成人時期通過檢查發現的腦部脂肪瘤，是處於長期、靜止、穩定期的脂肪瘤，不會引起患者出現明顯的症狀，在進行臨床的動態隨訪過程中，發現這類脂肪瘤也是處於穩定期，體積不會出現明顯的增大，不會對患者造成明顯的影響。

兒童期的脂肪瘤常位於胼胝體、第三腦室等部位，大部分兒童的脂肪瘤不一定引起顱內的症狀，只有一小部分的脂肪瘤，特別是位於胼胝體附近的脂肪瘤，患兒可以出現不同程度的癲癇及精神障礙和智力障礙，對患者造成一定的影響。

兒童時期發現的脂肪瘤有時還會合並其他的顱腦畸形，比如腦膜膨出、胼胝體發育不良等，患兒會出現一些相應的神經功能障礙。腦內脂肪瘤屬於良性腫瘤，在病理學上，並沒有惡變的傾向，所以大部分的顱內脂肪瘤處於穩定期，一小部分兒童的脂肪瘤可能會造成一定程度的神經功能障礙，並且由於所在的位置，可能引起進行性加重的症狀，對於這類兒童的脂肪瘤，有時需要手術處理。對於成年期的脂肪瘤，通常無需特別處理。