通常膽囊結石症狀常與其他消化道症狀相混淆，患者就診主訴為中上腹疼痛甚至胃疼症狀，但診斷結果考慮為膽囊結石引起的疼痛症狀。膽囊結石最明顯或最典型表現為中上腹疼痛，較易與其他消化道疾病相混淆。膽囊結石其他典型症狀為後背部放射痛，主要侷限於後背和腰部偏右側位置。

膽囊結石患者還可能出現其他併發症而引起相關症狀，如急性膽囊炎時患者會出現發熱、噁心、嘔吐等症狀，如果出現急性膽管炎時患者還會伴黃疸和寒戰症狀。但其他併發症如急性胰腺炎時，患者可能會出現劇烈腹痛，以及血、尿澱粉酶增高情況。如果合併膽總管結石、膽石性腸梗阻等，患者會出現相應消化道症狀。