胰腺囊腫在臨床上分為胰腺真性囊腫與胰腺假性囊腫，胰腺真性囊腫即在胰腺腺體內出現囊性腫物，囊性腫物有自身囊壁細胞，而且由於胰腺囊腫大多數也有惡性傾向，甚至本身即為惡性病變。因此對於胰腺囊腫應及早進行手術切除，才是治療胰腺囊腫及防止胰腺良性囊腫惡變的重要手段。

對於胰腺假性囊腫，發生的主要原因大多與胰腺炎有關，胰腺炎是胰腺自身的炎症反應，與自身消化有密切關係。當出現胰腺炎時，胰腺會形成較多局部滲出，如果滲出液過多，在網膜周圍腸管、系膜等臟器覆蓋下，將這些滲出液體形成局部包裹，使炎症侷限，長時間會形成假性囊腫。對於假性囊腫大多數只有通過內引流或外引流手術方式，才能將胰腺假性囊腫治療。