胰腺分裂症最主要治療手段為通過內鏡進行治療，可切開、擴張副乳頭，使其引流通暢便可解決問題。因為病人長期胰管擴張，可能會形成結石，所以病人需要在副乳頭上插管。進入胰管以後把副乳頭開大，結石取出後在胰管裡放置支架，引流通暢後病人症狀即可消失。

胰腺有主胰管和副胰管，主胰管是胰頭、體、尾均通行的管道，副胰管非常小，收集胰液較少。胰腺分裂症是常見的胰腺先天性發育異常，主胰管開到了副乳頭上，副胰管收集胰液增多。因為副乳頭小、液體多，所以大量胰液通過副乳頭時患者會出現症狀。胰腺分裂症發病率比較高，100個人中有5個人會出現胰腺分裂症，但在這5%的病人中可能只有5‰-10‰的人發病，發病後會反覆出現上腹部疼痛、胰腺炎。有的胰腺炎患者1年內多次發病，但也查不到別的原因，此時要注意是否存在胰腺分裂症，並要通過手術進行治療。