肉芽腫性乳腺炎治療療程比較長、非常難治且容易復發，通常需要堅持治療，通常在吃中藥的3-6個月逐漸好轉，但多存在個體差異。建議患者嚴格遵醫囑用藥，並根據自身情況調整用藥。
肉芽腫性乳腺炎屬於較為少見的、病因不明晰的、良性的乳腺疾病，患者多有小葉肉芽腫性炎症，病變多侷限在乳腺小葉中，與肝經溼熱蘊積、餘毒沒有清除乾淨等有關。患者可以遵醫囑使用柴胡舒肝丸、托里消毒散等中藥，以清肝火、清胃火、透膿等，多需3-6個月才能逐漸好轉。
但每個人對中藥的敏感性不同，病情輕重也有不同，服藥後好轉的時間也存在差異，有的可能不到3個月就慢慢好了，有的可能6個月多了還不好，甚至有加重趨勢或復發。建議患者到中醫科就診，經醫生辨證分型後再酌情使用中藥，同時配合針灸、艾灸等治療措施。
此外，如果肉芽腫性乳腺炎形成膿腫，還可以在醫生指導下外敷藥物，如如意金黃散、生肌玉紅膏等，或是穿刺抽吸膿液、切開引流膿液等，也能有效縮短病程。且治療期間要注意避免吃辛辣、生冷類食物，不要熬夜、勞累、受涼等，並儘可能調節情緒，以促進機體好轉。