肝癌晚期患者常出現黃疸，表現為眼黃、尿黃、身體黃，化驗膽紅素有嚴重升高。部分患者經過合理、恰當治療後，黃疸可以減輕甚至消退，也取決於引起黃疸的原因。如果是肝癌晚期，同時引起肝癌的原發病，比如乙型肝炎或者丙型肝炎，病毒仍然在複製，肝炎仍然在活動，此種情況下，黃疸主要是由於肝細胞炎症破壞所引起。此時控制病毒，通過適當保肝、護肝治療，控制肝臟炎症，減少肝細胞壞死，促進肝細胞再生，肝功能夠得到改善或逆轉。肝功能改善後，肝臟代謝膽紅素的功能得以提升，黃疸可以下降或消退。

此外，肝癌晚期，腫瘤壓迫肝內大膽管，導致膽汁排洩不暢，有時腫瘤發生壞死，黃疸可以自發緩解。有時通過治療，在肝內放置膽管或置入引流管，改善膽汁引流情況。如果能夠使膽汁排洩重新通暢，黃疸也可消退。