膽結石有可能導致谷丙轉氨酶和穀草轉氨酶異常升高，原因在於膽結石同時合併急性膽囊炎，炎症波及肝臟可引起二者異常升高，或由於結石掉入膽總管引起膽道梗阻，膽汁逆流入血出現膽汁淤積和黃疸，表現為肝臟指標異常。除轉氨酶升高外，還會出現鹼性磷酸酶、轉肽酶及膽紅素異常升高。
對於無症狀膽囊結石或膽囊結石引起的慢性膽囊炎，但沒有合併肝功能異常，轉氨酶指標可以正常。對於合併有肝功能異常的膽囊結石患者，還需警惕是否同時合併慢性肝臟疾病，包括病毒性肝炎、長期飲酒、脂肪肝等。嚴重肝硬化患者也易出現膽囊結石，此時膽囊結石治療更為複雜，手術風險更高。患者由於肝硬化、凝血功能障礙，會增加手術中出血風險。