目前肝血管瘤的病因不明確，一般與下列因素有關：

1、先天性發育異常，發生肝血管瘤是血管內皮細胞呈腫瘤性生長，往往伴有血管畸形，包括動脈畸形、靜脈畸形，大小血管都有發生，其在胚胎髮育過程中遺留，有的在出生後可發現；但是多數人是在成年後瘤體長大才被發現，早期沒有症狀；

2、雌激素刺激所致，一般女性青春期或者懷孕時，或者口服避孕藥，這時會使血管瘤生長速度加快；有血管瘤的嬰幼兒體內雌激素水平也高，所以雌激素是血管瘤的一種致病因素；

3、毛細血管組織感染、肝臟組織局部壞死，導致毛細血管擴張，肝內區域血液循環停滯，造成血管形成的海綿狀擴張，這些都有待考察。