良性腦腫瘤主要指腦膜瘤、垂體瘤或者松果體的生殖細胞瘤等。顱內的良性腦腫瘤可以採取手術切除的辦法，達到根治性治療或者治癒的目的。

垂體瘤也可以進行手術切除以及伽馬刀治療，伽馬刀適合3cm的腫瘤，特別是位置比較深的腫瘤。如顱底、腦幹的腦腫瘤首選伽馬刀立體定向放療，如果腦膜瘤比較大也可以實施分步切除。松果體的佔位性病變，很大程度上屬於生殖細胞瘤，生殖細胞瘤也是相對良性的腫瘤。